Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CROTQ9UKG9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms