Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MRTO4Q9UKD2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms