Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SLC24A2Q9UI40 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms