Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARHGAP28Q9P2N2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARHGAP28Q9P2N2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms