Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CNIH4Q9P003 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms