Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR3EQ9NVU0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR3EQ9NVU0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms