Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms