Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms