Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX3

NDUFA4L2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 4-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA4L2Q9NRX3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NDUFA4L2Q9NRX3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms