Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BIN3Q9NQY0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BIN3Q9NQY0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms