Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LHX9Q9NQ69 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LHX9Q9NQ69 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms