Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LY9Q9HBG7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LY9Q9HBG7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms