Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.27■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C11orf49Q9H6J7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C11orf49Q9H6J7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms