Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC8Q9H0W5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms