Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CTDSP1Q9GZU7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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