Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SENP6Q9GZR1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SENP6Q9GZR1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms