Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H9

SRCIN1, SRC kinase signaling inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCIN1Q9C0H9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SRCIN1Q9C0H9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SRCIN1Q9C0H9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms