Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms