Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SETD2Q9BYW2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SETD2Q9BYW2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SETD2Q9BYW2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SETD2Q9BYW2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SETD2Q9BYW2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SETD2Q9BYW2 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SETD2Q9BYW2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SETD2Q9BYW2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SETD2Q9BYW2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SETD2Q9BYW2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SETD2Q9BYW2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SETD2Q9BYW2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SETD2Q9BYW2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SETD2Q9BYW2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SETD2Q9BYW2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SETD2Q9BYW2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SETD2Q9BYW2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SETD2Q9BYW2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SETD2Q9BYW2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SETD2Q9BYW2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SETD2Q9BYW2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SETD2Q9BYW2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SETD2Q9BYW2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SETD2Q9BYW2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SETD2Q9BYW2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SETD2Q9BYW2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms