Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDM5DQ9BY66 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KDM5DQ9BY66 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms