Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4AQ9BY43 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms