Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC4A5Q9BY07 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC4A5Q9BY07 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms