Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SALL3Q9BXA9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms