Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLVAPQ9BX97 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLVAPQ9BX97 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms