Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
HIRIP3Q9BW71 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HIRIP3Q9BW71 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms