Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KATNB1Q9BVA0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms