Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHRDL1Q9BU40 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRDL1Q9BU40 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRDL1Q9BU40 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRDL1Q9BU40 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRDL1Q9BU40 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRDL1Q9BU40 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRDL1Q9BU40 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRDL1Q9BU40 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRDL1Q9BU40 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRDL1Q9BU40 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRDL1Q9BU40 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRDL1Q9BU40 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRDL1Q9BU40 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRDL1Q9BU40 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRDL1Q9BU40 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRDL1Q9BU40 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRDL1Q9BU40 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRDL1Q9BU40 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRDL1Q9BU40 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRDL1Q9BU40 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRDL1Q9BU40 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRDL1Q9BU40 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRDL1Q9BU40 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHRDL1Q9BU40 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRDL1Q9BU40 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRDL1Q9BU40 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRDL1Q9BU40 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRDL1Q9BU40 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRDL1Q9BU40 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms