Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSG1Q9BU20 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms