Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FYCO1Q9BQS8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FYCO1Q9BQS8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
FYCO1Q9BQS8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FYCO1Q9BQS8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FYCO1Q9BQS8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FYCO1Q9BQS8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
FYCO1Q9BQS8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
FYCO1Q9BQS8 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FYCO1Q9BQS8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
FYCO1Q9BQS8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FYCO1Q9BQS8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FYCO1Q9BQS8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FYCO1Q9BQS8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FYCO1Q9BQS8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FYCO1Q9BQS8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FYCO1Q9BQS8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FYCO1Q9BQS8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FYCO1Q9BQS8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FYCO1Q9BQS8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
FYCO1Q9BQS8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FYCO1Q9BQS8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms