Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CITED2Q99967 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CITED2Q99967 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CITED2Q99967 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CITED2Q99967 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CITED2Q99967 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CITED2Q99967 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CITED2Q99967 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
CITED2Q99967 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CITED2Q99967 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CITED2Q99967 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CITED2Q99967 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CITED2Q99967 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CITED2Q99967 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CITED2Q99967 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CITED2Q99967 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CITED2Q99967 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CITED2Q99967 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CITED2Q99967 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CITED2Q99967 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CITED2Q99967 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CITED2Q99967 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CITED2Q99967 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CITED2Q99967 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CITED2Q99967 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CITED2Q99967 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CITED2Q99967 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms