Protein–RNA interactions for Protein: Q99942

RNF5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF5Q99942 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF5Q99942 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF5Q99942 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms