Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ARID3AQ99856 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms