Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VAT1Q99536 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms