Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMD1Q99460 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMD1Q99460 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms