Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
DCLRE1CQ96SD1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCLRE1CQ96SD1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms