Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBL7Q96S82 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBL7Q96S82 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBL7Q96S82 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBL7Q96S82 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBL7Q96S82 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBL7Q96S82 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms