Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CITED4Q96RK1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CITED4Q96RK1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms