Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GCNAQ96QF7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms