Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
USP47Q96K76 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
USP47Q96K76 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms