Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMIGD2Q96BF3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms