Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
EXOSC8Q96B26 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms