Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UTP4Q969X6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms