Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX21Q969T3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms