Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SMARCE1Q969G3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SMARCE1Q969G3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms