Protein–RNA interactions for Protein: Q92784

DPF3, Zinc finger protein DPF3, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPF3Q92784 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
DPF3Q92784 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DPF3Q92784 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms