Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF31Q8WWY3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PRPF31Q8WWY3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
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