Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SFT2D1Q8WV19 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFT2D1Q8WV19 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms