Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SH3RF3Q8TEJ3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms