Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HELBQ8NG08 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HELBQ8NG08 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms