Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLHDC9Q8NEP7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLHDC9Q8NEP7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms